Изпълнителна агенция "Автомобилна администрация" има внедрена Система за управление на качеството, която е в съответствие с ISO 9001:2015. Сертифицирана е от 15.01.2018 г. от CERTIFICATION INTERNATIONAL (UK) LIMITED със сертификат № CI/8208.
Изпълнителна агенция "Автомобилна администрация" има внедрена Система за безопасно движение по пътищата, която е в съответствие с БДС EN ISO 39001:2014. Агенцията е сертифицирана от 02.11.2020 г. от SGS Bulgaria Ltd. със сертификат № BG20/871976